第一个项目“星际迷航”，要求挑战者陈智强从一面含有数以万计星星的大屏上，找出嘉宾选择消失的3颗星星。但在选手开始挑战前，郭敬明提出，规则中没有明确指出大屏中显示的是左右对称的星空图案，导致自己打高了难度分，并表示：“这就是个找茬游戏，如果早知道是对称的，预判分我可能就1分。”而魏坤琳立即表示：“在这个舞台上，无论是视觉还是听觉能力，都得过很高的分。”

　　第二个项目“钢管丛林”同时涉及到记忆力与体能。郭敬明认为这就是个扫雷游戏，选手赵文波“来错了舞台”，“赵文波并不足以被称为最强大脑，只能称之为最强体能。”魏坤琳反驳道：“运动好也是属于智力高的表现，这位选手有非常强的本体感觉，这也是人的智力的一部分。”

　　第三个项目“扎染密语”中，挑战者杨硕青需要发挥空间推理能力，观察被扎着的“疙瘩花”，随后推断这些“疙瘩花”展开后的扎染图样。杨硕青最终挑战成功，但魏坤琳给出的6分难度分却让他因总分低于80分而无缘晋级。魏坤琳解释说：“扎染的图案是很有限的，对空间推理能力考察不强。”这立即引发了郭敬明的不同意见，他接连列举了《三体》和《星际迷航》中多维度的例子为杨硕青鸣不平。

　　作为《最强大脑》科学团队的主力，北京师范大学心理学院院长刘嘉教授对三个项目一一作出解释。针对“星际迷航”，刘嘉表示：“郭敬明说这是找茬游戏，没问题，但他没考虑到星星数量太多造成的难度。”关于“钢管丛林”，他解释：“这个项目本质上讲确实是扫雷游戏，但它的难度在于，第一，选手必须蒙眼完成，还要记住路径；第二，选手要在丛林里面靠本体感觉保证方向，偏之毫厘就会掉下去。”而关于“扎染密语”，他则认可郭敬明的说法。

　　《最强大脑》制片人王刚解释，郭敬明和魏坤琳只是观点不同，但不会带着情绪打分。